BIOP01-83 블로그 7·8편 정정 + 블로그 정본을 저장소로 이전

[kakyungkim]

무엇을

박세진 님이 2026-08-29에 올려 주신 블로그 7·8편 점검(🔴 1건·🟡 6건·🟢 2건)을 반영하고, 그 과정에서 발견한 정본 소실 위험을 함께 닫습니다.

1. 블로그 7·8편 정정

제안하신 적용 순서(A·A-2 → H → F → B → 나머지)를 그대로 따랐고 교체 문구도 거의 그대로 썼습니다. 영문과 국문을 함께 고쳤습니다.

블로그 7 (9건)

• 🔴A "크로마틴이 전사 속도 α를 조절하는 유전자 지도" → "기저 상태에서 α로 이어지는 경로"(baseline-to-α). 영문 L210도 함께.
• 🔴A-2 별도 논문이 무산된 이유에 문단 추가. 발현량 단독 ρ=+0.724, ATAC 증분 −0.016, 편상관 +0.112, brain +0.212→+0.013. 교훈 줄도 수정.
• 🟡B 헤드라인에 발현량 기준선 병기 (α +0.262 vs abundance +0.410)
• 🟡C 외부 앵커가 Todorovski 한 소스임을 명시 (Schwalb 3/3 null, 두 소스 간 ρ≈0.15가 상한)
• 🟡D 방향 일치의 크기 병기 (54.6%, n=560, p=0.031, 대부분 |ρ|≤0.08)

블로그 8 (5건)

• 🟡H 한국어 표에 α_c(+7.32)·β(+4.86) 행 복원. "α_c는 평평하다"는 잘못된 서술을 영문판에 맞춰 교체. 한국어판만 기전 설명이 틀려 같은 페이지 영문 수치와 모순이던 건입니다.
• 🟡F marker 근거를 상관 수준으로 낮추고 marker-shuffle 음성(MW p=0.58) 병기. "생물학과도 맞는다" → "어긋나지는 않는다".
• 🟡G 선점 주장에 ConsensusVelo 선례 인정
• 🟢I 54.6%에 이항 p=0.031 병기 (영/한)

🟢E(곡률 절대값의 freed/fixed 조건)는 근거 파일 확인 후 별도로 넣습니다.

Confluence 게시본: 7편 page 66093061, 8편 66093078 모두 v1→v2 배너 삽입, 본문 무변경. 합본 00_all.md: 7/27 stale → 재생성 (225,919자 → 242,552자).

2. ★ 블로그 정본을 저장소로 이전

작업 중 발견한 것입니다. 블로그 정본은 서버 /workspace/blog/BIOP01/이었는데 GPU 반납으로 사라졌고, .gitignore가 blog/ 전체를 제외하고 있어 방금 반영한 정정본이 개인 맥 백업 한 곳에만 남는 상태였습니다.

오늘 BIOP02에서 다룬 CPTAC 누락과 같은 유형입니다. 산출물이 게이트 밖에 있으면 아무도 상태를 모릅니다.

블로그는 이미 Confluence로 공개된 글이라 저장소에 두어도 새로 노출되는 것이 없고, 이력과 검수 게이트가 함께 붙습니다.

• 반입: 01~08 여덟 편 + 00_all.md + glossary.md + 신규 README.md
• 제외 유지: blog/site/(생성물), blog/SHARE_안내.txt(사라진 서버의 scp 접속 안내가 담긴 낡은 내부 공지), build_index.py(심링크)
• 공개 전 스캔: 서버 IP·SSH 포트·토큰·이메일 0건 확인

README.md에 정본 규율을 적었습니다. 원고에서 철회·강등한 주장은 블로그에도 같은 세션에서 반영하고, 영/한을 함께 고치며, 00_all.md는 직접 고치지 않고 개별 편에서 다시 만듭니다.

3. 배너 스크립트 보강

• --marker 인자 추가. 날짜가 다른 배너를 여러 차례 붙일 수 있게 하고 멱등성 검사가 그 배너를 기준으로 돌게 했습니다(재실행 시 중복 거부 확인).
• 토큰 환경변수 fallback. ~/.atlassian_env가 ATLASSIAN_TOKEN을 쓰는데 스크립트는 ATLASSIAN_API_TOKEN만 찾아 실패하던 것을 둘 다 받게 했습니다.

안전성

• 편집 전 백업을 뜨고, 치환마다 정확히 1건씩 매칭되는지 드라이런으로 확인한 뒤 적용했습니다.
• 철회 대상 문구가 본문에 남아 있지 않은 것(0건)과 신규 근거 수치가 들어간 것을 토큰 대조로 확인했습니다.

남은 것

• 🟢E 곡률 조건 표기
• site/00_all.html 재생성 (서버와 함께 소실)
• 04편이 가리키는 /workspace/skills/harness-concept/ 경로도 사라졌습니다. 대체 위치 미정.